摘要准确量化生物年龄对于解析衰老机制、研发高效干预手段至关重要。分子衰老时钟（尤其是基于DNA甲基化数据的表观遗传时钟）已成为衰老研究领域的核心工具。然而，目前缺少覆盖多年龄、多组织且格式统一的公开DNA甲基化数据集，导致表观遗传时钟研究难以高效推进。研究者在数据集检索、原始数据关键信息提取、格式与元数据注释标准化处理等方面面临显著挑战。此外，领域内缺乏衰老相关差异甲基化位点（DMS，亦称差异甲基化位点/差异甲基化胞嘧啶）和差异甲基化区域（DMR）的专用资源库，阻碍了衰老表观遗传机制的研究进展。为解决上述问题，本研究构建了面向衰老生物学的综合性DNA甲基化数据库MethAgingDB。MethAgingDB收录93个数据集，包含人类13种组织的11,474条数据谱、小鼠9种组织的1,361条数据谱。数据库提供格式统一的预处理DNA甲基化矩阵、组织特异性DMS与DMR、基因水平的衰老相关信息，以及全面的表观遗传时钟合集。MethAgingDB可简化衰老相关表观遗传研究，为开发稳健、具备生物学意义的衰老生物标志物提供支撑。wanghaixin@301hospital.com.cnchenshengquan@nankai.edu.cn方法数据收集表1MethAgingDB收录的人类GEO数据集概览包含GEO登录号、样本数量、组织类型、参考文献数据收集表2MethAgingDB收录的小鼠GEO数据集概览包含GEO登录号、样本数量、组织类型、参考文献